1、目标不同。财务会计的目的是向管理部门、投资人、债权人及其它相关的报表使用者提供财务状况、经营成果和现金流量的信息，便于报表使用者做出决策。税务会计的目的事项信息使用者提供所得税方面的信息，便于税务部门征税。财务会计目标的实现方式是提供报表即资产负债表、损益表和现金流量表。税务会计目标的实现方式是纳税申报。           

2、法律依据不同。财务会计的依据是会计准则和会计制度，按照会计准则和会计制度的程序和方法组织会计核算和提供信息，并结合企业自身生产经营实际需要加以选择。税务会计的依据是税收法规按照税法规定计算所得税额并向税务部门申报且不能任意选择或更改。

3、核算基础不同。财务会计以权责发生制为核算基础，以应收、应付作为确认收入费用的标准，能使收入与费用恰当地配比，便于确定各期经营成果，使会计信息更加准确、相关和有用。税务会计主要以收付实现制和权责发生制的共同作用为核算基础，比应收应付标准更加准确，即操作简便，又可防止纳税人偷税漏税行为。

4、对会计上的稳健原则态度不同。财务会计实行稳健原则，一般充分预计可能的损失和费用，而不预计可能的收入，使财务报表反映的财务状况和经营成果不致被报表使用者误解，税务会计一般不对未来损失和费用进行预计，只有在客观上有证据表明己发生的情况下法可确认。当然，也不否认税务会计在某方面也具有稳健的意思，如计提坏账准备和加速折旧等。

5、核算对象与内容不同。财务会计核算的是会计主体范围内与货币资金有关的所有经济业务。税务会计核算的是与纳税有关的经济活动，对纳税申报、税款解缴、税款减免、税收筹划进行专门核算。内容包括:流转税会计、所得税会计、其他税会计。而财务会计则把这些作为附属工作。

6、程序不同。财务会计规范化的程序是“会计凭证—会计账簿—会计报表”的顺序。凭证、账簿和报表之间有密切的逻辑关系。税务会计主要划分为以下四个环节:确定计税依据;计算税款;税款的申报、缴纳和清算;税款的账务处理。