(一)税务管理及筹划意识薄弱

    从现在的一些研究资料来看，科研事业单位在社会管理过程中主动纳税的意识并不是很强，很多科研事业单位都是在管理机关发出纳税通知以后，才着手进行纳税管理工作，而在日常管理工作中，尤其是在财务管理工作中，税务管理的重视程度严重不足，纳税意识相对比较滞后。并且在税务管理工作中，对税收筹划工作的重视程度存在明显的不足。很多科研事业单位的管理者，尤其是财务管理部门的负责人，往往认为科研事业单位属于国有事业单位，无论是经营业务所产生的业务收人、还是税收，都需要上缴国库，而管理工作和税收筹划工作虽然可能会影响科研事业单位的税负，但是木质上不会对科研事业单位的各项工作产生太大影响。在这种情况下，科研事业单位的税务管理工作相对比较滞后，很多科研事业单位没有根据自身的业务开展建立科学完善的税收筹划。                  

    (二)纳税筹划实践能力不足

    税收筹划的能力是科研事业单位做好税收筹划工作的前提和基础，要想真正地通过税务管理和税收筹划控制和降低税负，科研事业单位必须具备较强的税收筹划实践能力。但是从目前来看，科研事业单位的税收筹划能力相对比较薄弱，这主要体现在以下几个方面上。**，科研事业单位的税收筹划工作几乎都是由财务管理部门负责的，单位的领导虽然也会参与到税收筹划工作之中，但是不管是财务管理人员还是单位的领导，在税收筹划上都没有非常丰富的经验，也缺乏专业的理论知识作为支撑。第二，对科研事业单位各项业务收人以及对相关国家政策、法律规定的认识及了解程度一般，无法将国家政策及法律规定与单位业务收人和税收筹划工作有效地结合起来，在一定程度上影响了税收筹划能力的提升及其实效性。

    (三)管理岗位设置不专业

    事业单位财务管理部门负责税务管理和税收筹划工作，但是在财务管理部门内部的岗位工作设置上，并没有设置专门的财务管理岗位，更谈不上设置专门的税务管理部门。实际上的税务管理工作是由财务管理部门具体负责，从税务管理专职化的工作角度来讲，由财务管理部门负责税务管理工作，虽然可以将税务管理工作与会计核算工作有效地结合起来，但是财务管理部门的工作重心在于会计核算和财务管理，税务管理并非是财务管理部门的主要工作内容。在税务管理工作没有达到专业化的前提之下，很难做好税务管理工作及税收筹划工作，这也是制约和影响科研事业单位税务管理能力水平提升的关键要素之一。

    (四)税务会计核算过于简单

    税务管理工作能力和水平是建立在会计核算的前提和技术之上，对于科研事业单位来说，会计核算能力越强，越能为税务管理工作尤其是税收筹划工作创造良好的条件。但是从目前来看，科研事业单位在税务会计核算工作中采用的是相对比较简单的方法，整体采用业务收人的方式进行核算，这种合作方式虽然可以极大程度地降低财务管理部门税务会计核的工作量。但是，这也会影响会计事业单位的税务管理能力和筹划水平。大部分科研事业单位在税务会计核算工作中，没有根据自己的业务结构分门别类地进行税务会计核算，传统的税务会计核算已经不能适应当前经济社会的发展需要，尤其是科研事业单位自身的发展需求，需要在今后的会计管理改革当中加以完善和调整。

    (五)缺少与税务征管部门的有效沟通

    经营性科研事业单位的税收政策也在不断调整和变化，对于科研事业单位来说，在税务管理工作中，对新的税务管理政策了解不够透彻和深人，对税务政策变更也米做到及时了解。在这种情况下，就需要与税务征管部门及时进行有效的沟通和对接，积极了解国家有关科研事业单位的税收政策。但是从现有的一些研究资料和科研事业单位的税务管理工作来看，在税务管理工作中，管理人员很少主动与税务征管部门进行有效的沟通和对接，一般情况下都是税务征管部门反馈出具体问题以后，科研事业单位才根据税务征管部门的反馈进行调整，这样的工作模式较为被动，还可能因为纳税不及时造成缴纳滞纳金、罚款等情况的出现，导致科研事业单位的税负增加。

    (六)税务人员的专业素质与管理素质不高

    税务人员的专业素质和管理素质，对科研事业单位的税务管理工作和税收筹划工作的质量有非常明显的影响。但是从现有的研究资料和自身的工作情况来看，税务人员的专业素质和管理素质不高，已经成为制约科研事业单位税务管理能力和税收筹划质量的重要问题。一方面，绝大多数科研事业单位的财务管理人员，并没有经过系统的税务管理培训教育，之所以走上税务管理工作岗位，只是单位的岗位工作安排和要求，他们的知识和经验都是在工作实践当中逐渐积累的，这会极大地影响税务管理，尤其是税收筹划工作的专业性。另一方面，他们自身对税务管理和税收筹划工作的认识和理解程度有限，工作的责仟心并不是很强，没有全身心地投人到科研事业单位的税务管理和税收筹划工作之中。