(一)坚持财务会计和税务会计协调的原则

    要协调好两者之间的关系，就要遵循财务会计和税务会计协调的原则。**，内部审计实施中要坚持合理性的原则。在企业中，会计制度和税收法依据的准则、理论基础等都有着明显的差异，因此要重点考虑二者之间进行协调时是否具有合理性。第二，内部审计实施中要坚持效益大于成本的原则。这是始终要秉持的原则。            

    (二)内部审计实施重点关注企业是否建立健全税务会计的理论体系

    要建立并完善税务会计的理论体系，及时协调税务会计，在这个过程中，要对宏观的税收学的基本理论等进行转化，使其成为适用于税务会计的税法学的基本理论等，然后借助会计学的理论等，利用会计系统统计出企业需要缴纳的税款，并保证统计的真实性和有效性，从而促进我国税务会计的发展。

    (三)在具体操作上采取不同的标准导向

    会计制度和税法法规在处理一些具体的业务工作时，要加强对它们的协调，首先要坚持税收自身的原则，同时，要和会计原则保持合作的关系，使他们尽可能协调。另外在这个过程中，存在会计处理不规范、制度上留有业务空白的现象，要不断完善会计制度，同时还要重视和税收法规的协调和合作。

    (四)内部审计实施中监督企业建立健全独立的税务会计核算体系

    在协调两者的管理中，要建立独立的税务会计核算体系，其中可以从两个方面考虑，**，要依据税务会计的要素，对企业的众多经济事项进行分类，同时，要对其进行整体的核算。即在施行的过程中，要根据原始的凭证，做出两套账目。第二，只对纳税调整事项进行核算。二者之间的分离要求建立新的核算体系。